第二層陣法就是一個清靈陣，沒有別的作用，就是保持靈台清明，可這石胎中孕養的是非天非地非神非人非鬼，亦非蠃非鱗非毛非羽非昆，不入十類之種中為首的靈明石猴的神魂。
這靈明石猴的天賦是通變化，識天時，知地利，移星換斗，而佛門明顯是怕孫大聖識天時和知地力，因為他們不能讓他知道前因後果，如此，就要壞掉悟空的神通。
那最好的時候就是悟空出世之前，他現在是石胎，其實跟人還在母親腹中做胎兒的時候是一樣的，這時候就是打根基，胎兒養不好，出生就體弱多病，石胎沒養好，化形的時候自然也沒辦法掌握伴生神通。
胎兒每天大半時間都是要在母體中睡眠修養，然後吸收營養，石胎也一樣，他應該是偶爾清醒，但大半時間都要沉睡，吸收補天石跟地脈的供養，然後得到神通傳承。
可是這清靈陣卻會讓石胎一直保持清明，也就是睡不著覺，這讓他哪有時間去吸收靈氣，得到傳承。
然後，四周的生物也沒有能靠近的，畢竟，這樣的地方怎麼可能有普通沒修為的生物出現，其他的生物都知道這裡靠近了會不舒服，自然也會避開。
一個人一直孤單的在一個環境裡，沒有被逼瘋已經是大聖心性好了，加上一直沒辦法休眠，這跟長期失眠的人有什麼區別？
難怪出世後的大聖脾氣暴躁，又特別喜歡熱鬧，明知道那些猴子並不是真心接納自己，還是利用自己並不多的天賦，查勘地脈，確定水簾洞沒有危險，然後冒險去做，以換來猴群的接納。
《西遊記》中的孫悟空這隻靈明石猴其實是廢了，什麼神通都不行，所以，只能從靈明石猴變成了天產石猴，靈明石猴不入十類之種，不歸兩界管轄。
也就是說不管天庭天榜封神榜還是地府冥書生死簿都不能記載他，但偏偏生死簿上有他名，只是記載的不是靈明石猴。
所以，大聖這一生都是悲劇，是人為算計的悲劇，還是從他沒有靈智就開始的，就連那傳給悟空的七十二變，說白了也不過是激發了人家的天賦神通通變化罷了，就這還是沒激發全的。
石磯伸手就要去破陣，這時孫悟空卻制止道：「老祖，既然有人特意布下這樣的陣法來害我，之後自然是要回來的，不如留下這陣法，看看到底是什麼人這般惡毒。」
「若是功夫不行的，老祖直接幫晚輩報仇就是，若是功夫了得的，晚輩現在還不能化形，不如先蟄伏著，省的老祖顧忌晚輩，還要束手束腳的受人氣。」
石磯想了一下之後笑道：「你這小子，倒也聰明，我頑石一族，沒想到還有你這樣聰慧的後輩，實在值得慶祝。」