帝見敦黨盡平，下詔命有司發王敦之屍，焚其衣冠，跽而斬之。
將其頭並沈充、錢鳳、杜弘等一同懸於朱雀桁，以示不道。
百姓觀者如市，無不稱快。
後人有詩嘆曰：逆賊敦充鳳，欺君更害民。
今日昭彰報，懸頭朱雀桁。
晉太寧三年，西趙光初八年，後趙太和七年，晉明帝平定王敦，乃大赦國中。
封司徒王導為始興公，食邑三千戶。
溫嶠為建寧縣公，庾亮為永興縣公，卞敦為建興縣公，紀瞻為長興縣公，郄鑒為德興縣公，蘇峻為廣陵縣公，劉遐為陵泉縣公，各食邑一千八百戶。
殿上將軍趙胤封湖南侯，卞壼封益陽侯，食邑一千五百戶。
五將軍段琇封溧陽伯，韓潛封丹陽伯，曹渾封暨陽伯，鍾寅封東陽伯，陳嵩封松陽伯，各食祿一千石。
虞潭、周騫皆封縣子，食祿八百戶。
周光、周撫、鄧岳、鄧遐、吳儒改邪歸正，皆封列侯，實授討逆將軍。
其餘各部將校，論功加職。
追贈譙王司馬承、戴淵、周顗、刁協、郭璞、甘卓、周筵、周玘、周嵩、焦廷等官。
遣人致祭虞悝一家，立祠祀之。
時周扎父子亦被沈充所害，未蒙錄功賜諡，扎故篆虞潭上表為扎訟冤。
尚書令卞壼立議，以周扎守石頭之日，開門延寇，不當追贈。
王導上言曰：“嚮往之事，王敦奸逆未彰，自臣等有議以上，皆所未悟，與扎無異。
但悟其奸，即能以身徇國，尋被梟夷。
臣以為宜與周、戴同例。
”帝從之。
有司又上言：“王舒、王廙、王彬諸人乘敦之舉，分掌大鎮，不行報國，司徒等皆以討逆封賞，舒等既墮敦黨，理合除名。
”帝念導保宗親，乃下詔與彬、舒曰：司徒導以大義滅親，猶將百世宥之，況舒、彬皆其從親乎?舒又能忠不私親，預呈敦逆，後沉含、應，收斬呂猗;彬亦屢責敦逆，誠毅可尚。
兩既不附，一無所問，仍領原職，竭心任事，君臣如舊，同保歲寒。
惟王?督催魏義攻逼長沙，縊害譙王，拿至京師，審擬發落。
舒、彬二人得詔，感帝明辨之恩，各具表上朝伏罪，即使桓宣至荊州，督令有司械王廙至京，帝命與諸葛瑤、任悅等一同禁錮於獄，以伺會審。
溫嶠上疏曰：王敦剛愎不仁，忍行殺戮，處其朝者，恆懼危亡。
原彼私心，豈遑安處?斯輩悉心贊導凶悖，合宜正以典刑。
若其枉陷奸黨，如謝、樂、徐、潘者，又宜施之以寬，貸之以德，仰見聖心。