但也無濟於事，她們最終還是因為靈魂寶石的污濁過多, 轉化成了魔女。
因為這一起駭人聽聞的魔法少女人.體實驗案件, 九頭蛇可以說這個世界上，除正聯、復聯兩大組織外，掌握魔法少女與魔女之間相關性最多的組織。
也因為他們手中掌握著這些資料, 面對著越來越頻繁出現的魔法少女和魔女，從來不甘只做個地下陰溝里的蟲豸的九頭蛇, 一直都覬覦著魔法少女。
為了保護這些不斷出現的魔法少女, 也為了能夠研究消除魔女的辦法，正義聯盟和復仇者聯盟從很在開始就向全世界的魔法少女發出了友好邀請。
有一部分魔法少女願意信任他們, 但還有一部分魔法少女對超級英雄的態度是警惕的。
超英們的保護本身也是一種監視，何況復仇者聯盟又是眾所周知的半官方組織, 讓很多對政府極其不信任的魔法少女們連帶也對投靠超英顧慮重重。
她們大部分認為，只要自己藏好身份，僅僅只是消除魔女獲取所需的悲嘆之種，不要學著去做什麼超級英雄，那麼不必投靠超英也能安穩的生活下去。
這是大多數十幾歲少女的天真幻想。
事實上，現實要殘酷的多。
她們必須接受這個全球化的世界，想要隱藏身份是件極其困難的事。
即便是蝙蝠俠，在做多了那麼假面的情況下，也仍然數次面臨身份危機。
這些十幾歲的少女通常只是普通女孩，她們沒有哥譚騎士的財力和能力，只要她們主動或被動的狩獵魔女，就難免留下破綻。
不要小看九頭蛇的特工，這是一群能把神盾局這種官方組織都滲透成篩子的人。
調查一群魔法少女對他們來說和新手村任務區別不大。
超級英雄、反派組織、魔法少女……這是一場立足於世界背面的戰爭。
戰爭中最複雜的往往不是實力的差距，而是人與人的矛盾。
大量始終無法與超級英雄們達成共識合作的魔法少女們，後來不僅面臨著魔女化的威脅，還面臨著反派組織的覬覦。
而超級英雄們也不是神明，他們和普通人也沒有太大區別，在一連串的陰謀打擊下，兩個聯盟都搖搖欲墜。
這時的他們連保全自己都很難再做到，又遑論是保護數量逐漸攀升的魔法少女。
即便是反派組織，如今也同樣要和超級英雄、魔法少女們一起面臨共同的威脅——魔女正在摧毀這個世界，從哥譚開始。
但大多數人尚且沒有意識到這一點，腐敗的政府、貪婪的政客、野心勃勃的九頭蛇、瘋狂的阿卡姆罪犯團……
超級英雄們疲於應對無處不在的罪惡，又要不能忽視越來越頻繁出現的魔女，還得被動接受失去隊友的悲傷。
魔法少女們的處境也日益惡劣。
有難以接受現實而自願墮落成魔女的女孩。