但是另一方面，在激战仍猛烈地继续进行时。情况似乎突然有所好转。十一月一日对现场情况进行了观察之后，凯塞林认为最危急的关头已经度过。与此同时查诺伯爵在其日记中也提到，墨索里尼情绪很好，他认为这是北非“战事的顺利发展”而致。可是这些愉快的印象，很快就由于后续不太有利的报告而消逝。这些报告使得意军最高统帅部不得不于十一月二日下达一项命令，即“不惜任何代价”守住阿拉曼的阵地。同一天下午晚些时候，希特勒也感到有必要给隆美尔发一份热情洋溢的无线电报，鼓励他固守到底。电文一开始，希特勒就表白了他对在北非的部队及其司令的充分信任，然后再次宣称在这种形势下，“不能有其他想法，只能坚持到底，寸土不让”。尔后，他正式许诺要尽最大努力提供必要的补给品及装备，接着在电报结尾时对隆美尔陆军元帅本人嘱咐道：“以坚强的意志战胜强大之师，这在历史上不乏前例。你可以向你的部队指明这条唯一的道路，不胜利毋宁死！”
然而，在这封冗长的密码无线电报抄下来、译好再送到隆美尔手中时，他早已决定——在十一月二日晚上十点——进行有秩序的撤退。在这次历时十一天的战斗中，英军凭着取之不尽用之不竭的弹药不断猛烈轰击轴心国阵地。因此隆美尔置反复给他的命令而不顾，决定把他的部队完整地从阿拉曼撤出，决不拖下去让他们送死，他认为这是他的责任。
他自己向我们描述了十一月三日上午的情景：“我们的车辆成密集队形向西运动。意大利步兵则徒步撤离”。然后，下午一点半他收到了从德军最高统帅部发来的希特勒的无线电报。隆美尔可能以为这是希特勒答复他前晚呈报的关于撤退决定的报告（其实在撤退开始后才呈报），于是隆美尔就听从了他的劝说——再次违背自己较明智的判断——停止撤退继续战斗。可是还不到二十四小时，他又被迫再次与敌人脱离接触，没有等待进一步的命令就往西撤——这次就一去不复返了。他后来写道，“那两天（可能是指十一月三日下午早些时候到十一月四日）决定了我们的命运，因为在这样短的时间内，我们损失了近二百辆坦克——我们装甲部队残存的坦克；以及意大利部队之大部。由于这个原因，我们就没有可能进行机动战斗撤退。至此部队已溃不成军，唯一的办法就是继续采取规避行动。”
隆美尔在收到希特勒无线电报后的报告中，把部队的情况还说得比较顺利。这时，他仍然指望一种比较机动的作战加上一种寸土必争的搏斗能继续给敌人以重创，同时使轴心国无须放弃整个北非。尽管这清楚地暗示了一旦情况恶化将会发生的问题，但隆美尔的报告加上急忙派到统帅部的一个参谋的口头补充汇报仍给德军最高统帅部一种印象，即最坏也不过是撤退到利比亚与埃及的边界线为止。基于这种信念（似乎在意军最高统帅部下达的相应命令中得到证实），希特勒打算批准隆美尔撤退的决定。然而，他的不满需要有发泄之处，结果全部迁怒于德军最高统帅部作战局的两位军官身上，指责他们——很不公正地——没有及早将隆美尔撤退的意图上报给他，以便加以干涉与制止。