遣使葬宋理宗顶骨于绍兴永穆陵。先是，上与侍讲学士危素论宋元兴替，素因言：“元世祖至元间，胡僧嗣古、妙高欲毁宋会稽诸陵，时夏人杨辇真加为江南总摄，奏请如二僧言，遂发诸陵，取其金宝，以诸帝遗骨瘗于杭之故宫，筑浮屠其上，以厌之。又截理宗顶骨，为西僧饮器，天下闻之，莫不心酸。”上闻，叹息久之，谓素曰：“宋南渡诸君，无犬失德，与元又非世仇，元既乘其弱并取之，何乃复纵奸人，肆酷如是耶！”即命北平守将吴勉访索顶骨所在，果得之西僧卢中，既送至，命有司厝于京城之南。至是，绍兴府以永穆陵图来献，遂敕葬于故陵。
升守兴元、凤翔卫指挥金兴旺为大都督府都督佥事，仍守兴元。命秦王府武相耿炳文兼陕西行省右丞；都督佥事郭子兴为秦王府武传，仍兼陕西行都督府佥事；都督同知汪兴祖为晋王府武传兼山西行都督府同知，位居武传谢德成之上；都督佥事张温兼陕西行都督府佥事。温先守兰州有功，及是，入谢。上谕之曰：“兰州之捷，可谓奇功。夫将帅之道，有功不伐，则功益显；恃功骄恣，则名益隳。是故惟仁者不矜其功，而智者克成其名，仁智兼全，所向无敌。若乏仁寡智，虽有勇敢之士百万，不足恃也。古者仁智之将，抚摩安辑，见情达变，坐而制胜，以树勋立名于当时者，国家莫不倚重之功名始终，万古不朽，其余悍骄恣横者，及其成功之后，即复纵肆，以致败亡，此盖勇力有余而仁智不足故也。传曰：‘高而不危，满而不溢。’又曰：‘功盖天下，守之以谦。’尔能守此为戒，则可以长保富贵矣。”
故元四大王寇大同、武州，太原卫指挥桑桂等击走之。四大王者，元之宗室也，初，大军克元都，遁入太原静乐岢岚山中聚众，结塞自固。至是，寇武州，劫杀人民，桂与指挥郑亨率兵击之，追至牛尾庄，四大王遁走，获其三大王脱忽的帖木儿送京师。
辛巳，令民间立义冢。上谕礼部臣曰：“古者，圣王治天下，有掩骼埋觜之令，推恩及于朽骨。近世狃于胡俗，死者或以火焚之，而投其骨于水，孝子慈孙，于心何忍？伤恩败俗，莫此为甚。其禁止之。若贫无地者，所在官司择近城宽闲地为义冢，俾之葬埋，或有宦游远方不能归葬者，官给力费以归之。”
山西行省言：“大同粮储，自陵县长芦运至太和岭，路远费重，若令商人于大同仓入米一石，太原仓入米一石三斗者，给准盐一引，引二百斤。商人鬻毕，即以原给引目，赴所在官司缴之，如此则转输之费省而军储之用充矣。”从之。
上谕中书省臣曰：“苏、松、嘉、湖、杭五郡地狭民众，细民无田以耕，往往逐末利而食不给。临濠，朕故乡也，田多未辟，土有遗利，宜令五郡民无田产者往临濠开种，就以所种田为己业，官给牛种舟粮，以资遣之，仍三年不徵其税。”于是徙者凡四千余户。
监察御史郑沂言：“京师为天下根本，四方之所，瞻仰爵位之设，当使内尊而外卑，内重而外轻，所以隆国势而安天下也。今南京、北京知府与在外散府知府同称，甚失内外之统，宜改应天府知府为南京尹，则国体尊而爵位当矣。人命至重，古人所矜，各府宜设推官一员，专掌刑名，不预他政，庶责有所归而人无冤抑。又殿中侍御史之设，所以备顾问司谏诤，其员不可一日缺也，今久虗其职，岂以天下之大，人材之众，而无能胜其任者哉？宜从铨注，以肃朝仪。又各处虽立递运，而凡转送官物多僦民船，每致扰民，今当广增递运船数于税粮内定民赀力之厚者以充之。国家征伐，必资马匹，宜于两淮空闲之地，设牧马之官，选牝马餋于其中，数年之后，孳息蕃衍，足以备武事。”上皆从之，惟开封有行省，府仍其旧。