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过了几日，徐晖祖上折子，提出现在的武官考评之制有些地方不太妥当，请求修改。这事就是允指使的，当然马上批准。然后又过了些日子，他将新的武官考评之制送到允桌前，允下发大都督府各衙门议论。
允对武官考评之制的变化不大，主要就是修改了一下和平时期武将的升迁，以及文职武官的评定标准。虽然允喜欢打低烈度的战争，认为和平时期军队会慢慢朽坏，不愿意军队长期不打仗即使是现代军队和平久了也会出现各种各样的问题，更不必说古代军队了但对于大明来说，因为周边的国家基本都比大明要穷，大多数对外战争都不会有什么收益纯花钱，而且战争对农业国的生产影响比较大，他也不能每天都挑起战争，未来和平时期会越来越多。所以他必须制定更加合心意、对国家有好处的武将升迁平定标准。
至于文职武官的评定标准制定也是十分必要的。文职武官虽然是武官，但干的活是文职的活，自然不能用武将的评定之制，但军事机构做事的要求和政务部门做事的要求还有些不太一样，现在沿用的文官评定之制也不合适，必须制定新的制度。当然，他为了能够不对文职武官的工作产生多少负面影响，变化也不大。
所以不论文职武官还是武将都没有提出异议，这个考评之制就通过了。
正如他们兄弟所预料的，徐家再次引起众人的妒忌。你本来就是大明第一勋贵，徐晖祖又是新一代将领中立功最大之人，现在又这么受皇帝宠信，不妒忌你妒忌谁？
徐晖祖也按照之前的谋划，正式上奏折，请求准许他辞官。他今年才四十岁，告老自然不太合适，琢磨来琢磨去还是认为用伤病为借口最好，就以之前在伊吾之战受了伤，一直没好透，最近又有加重的迹象，难以处理大都督府的差事，所以请求辞官。
允接到徐晖祖请求辞官的奏折的时候即有些惊讶，也有本就在预料之中的感觉。说本就在预料之中，是因以徐晖祖之聪明与谨慎，早就该看出徐家有成为众矢之的的迹象，上折子请求辞官十分正常。
说有些惊讶，是惊讶于他这个时间。他当初本以为回京后徐晖祖就会辞官，还打算挽留他，连挽留的折子草稿都写好了，但徐晖祖却并未辞官，之后大都督府的差事理顺了，他还是没有辞官，可现在却辞官了。
允哪里知晓，徐晖祖确实刚刚返回京城就打算辞官，但一来允随即进行军事改革，他这时辞官好似对允的改革不满一般（虽然允自己并没有想到）；二来徐膺绪的两个儿子景珩和景璜也年满十六岁，可以入卫所历练了，他还得安排两个侄子的前程，就没有辞官。
之后等大都督府的差事理顺后他又琢磨起让徐增寿去南洋之事，想把增寿安排到南洋后再辞官，就又耽误下来；等找到了将徐增寿调到南洋的合适借口，允又交给他制定武官评定之制的差事，他只能将这个差事办完后再辞官，也就是这次辞官的时间。
不过不管徐晖祖为何会拖到这个时候才辞官，他此举都和允心意。虽然他打算打造一个贵族统治阶层，但这也不是短时间内能实现的，他为了维护自己的统治，现在仍然只能用传统皇帝的那一套，不让军中只有一颗将星闪耀，可此时徐晖祖这颗星星比其他人都更加耀眼一些。
所以允只能暂时将他冷落一段时间，等其他的将星也如同他一般闪耀后，再任用他。
当然，作为礼节，徐晖祖的奏折允不能马上批准，要挽留三次，三次之后才批准了他辞官的奏折。
此事在军中影响不大。在辞官之前徐晖祖已经将此事与亲近的武将说过，他们也都明白怎么回事，不会因此以为徐家失了皇上的信任，有些慌乱的中下级武将也都被安抚好了，没发生什么事情；更何况其它勋贵也明白这是徐家以退为进，也不会趁机做什么，所以相安无事。
见到徐晖祖上奏折以伤病为由辞官，耿炳文也赶忙上奏折辞官，请求在家养病，允也照例挽留三次后批准。
随后允任命了新的都督同知。其中一人不出徐晖祖所料是蓝珍。蓝珍是大明最后一个追封王爷的勋贵蓝玉之子，世袭国公，又几次带兵出征立功不少，新一代将领中是仅次于徐晖祖之人，担任都督同知丝毫没有争议。
但他任命的另外一个都督同知的人选，却在大都督府引起了一定争议。因为他任命了张辅。张辅不论资历或是功劳都与都督同知这样的官职有些差距，许多将领都不太满意，就连张辅自己也十分惶恐，上奏折请辞。
但允不仅驳了他的奏折，还将他叫到宫里说话，让他宽心做都督同知，不必担心什么。