此外在京城中闹得沸沸扬扬的，便是种痘一事。
因顾励是先在自己身上试过，这事情早在京城中闹得沸沸扬扬，人尽皆知，此后他才在百姓中招募试病人，所以也没什么人指责他。反倒是他说了若有人因种痘而出事，可给与其家人金钱赔偿，竟有不少百姓报名参与。
此外顾励又让人给宫中的内侍们都种上痘，就连冷宫中的郭昭仪也没忘记。除了太后死活不肯接种，声称顾励要害她，在慈宁宫里发疯把顾励派去种痘的医官们赶走，其他人都接种了牛痘。贞儿发了两天疹子，有些闹腾，顾励只能衣不解带地守着他。
耿崇明带着妻女回京时，便发现种痘一事，街头巷尾都在谈论。他刚从山东一带回来，路途上倒是有见过《大楚晨报》，也看到过那篇以他为原型的《耿郎君赴京告御状》，就连那篇《入狱记》他也给女儿读过，只是人不在京城，这事情听得缺胳膊少腿的，便仍不是很清楚。
听说陛下在征招试病的百姓，他便想去报名，妻子百般阻拦，耿崇明说：“陛下千金之躯，都已试用过这法子，我试一试，又有什么紧要！”
他妻子只得说：“听人说试种了这牛痘，便会起疹子，发热，你不是赶着去向陛下复命吗？若是生了病，还怎么复命。”
耿崇明只得先罢了，把妻女送到住处，一个人进了宫。
顾励请他探查全国各地的吏治，他便认认真真把事项都记下来，东北一带哪个地方哪个官是个好官，做了哪些好事，哪个官是能人，做了哪些事，哪些官是贪官，搜刮百姓，哪些官是庸官，胡作非为，他都记在本子上，交给顾励。
顾励看过，登时高兴坏了，让人赏赐耿崇明，郑重向他道了谢，又留他在宫中吃饭，想再问些别的。
顾由贞也跟着他一起吃饭，耿崇明见顾由贞堂堂一个皇子，吃的也不过是些普通饭菜，忍不住开口问道：“陛下吃的便是这些饭菜么？”
顾励解释道：“朕该做个表率，爱惜民力，勤俭节约，如此一来，大家伙儿才会跟着照做。”
耿崇明神色复杂，说：“陛下在宫中过着这般清苦的日子，却有些官员坐拥良田美宅，太不公平。”
顾励笑道：“若这些官员乃是通过不正当行为才得来良田美宅，耿君把名单报来，朕自会察纠。若是良田美宅乃是继承自祖上，那朕也没甚法子，总不能把他们的祖上掘出来审问，是否曾经贪污受贿，鱼肉百姓。”
耿崇明笑了一下。
顾励又问：“这次你去的乃是东北一带，路上可还顺利么？朕颁布了告示，让粮商们运粮去辽东，有没有粮商们送粮？”
耿崇明正色道：“自北京北去徐州，路上有不少响马贼，我见到不少粮商，都是成群结队运粮通行，路上若运气不好，碰上贼人拦路，还得交一笔买路钱。幸而陛下给的粮价高，这些粮商有些赚头，否则怕是不愿送的。”