卡格尔也进入了魔方，并且掉落在了查利的附近。而此时的查利正在帮助WU躲避异形生物的攻击。在这个魔方空间里，所有的生物都像是虚构的，他们看得到却摸不着，可以从眼睛里射出来的有攻击性的光线。WU说，这些怪物是靠吸取人类的精神力生长。他们是魔方里的“细胞”，他们被无数人的精神力滋养，想要离开，就要像魔方一样，让相同的梦境连接，当“魔方”拼成之时，一切才会结束，他们才会从这场梦境中离开。
WU交给查利一个小魔方。查利转动了一下，就发现天空的景象发生了改变。不再是蓝天白云，而是倒着得山川河流。景象诡异恐怖，查利也终于明白，这不仅仅是一个梦，这也不是WU在欺骗自己。这是自己正在经历的一切。
故事里的WU是在第一块魔方链接成功的时候被“细胞”杀死的。看着眼前渐渐成为白色气体的少年，查利却无能为力。但他总是残存着希望，这如果是某些力量用梦境来蚕食人类的精神，那么如果自己可以将这里毁掉，或许WU也可以从这场梦境中苏醒，他的人一定还活着！
在之后，查利在一个一个的魔方之间穿行，击杀“细胞”，寻找女儿，也在努力的想要离开，因为他的脑海里还可以听到WU的声音，他确信WU没有死。
梦境的每一个块都有一个单独的小故事。那是不同人的梦境。只有当找到梦境的主人，为他解开梦境的“枷锁”，这个魔方才能被扭动。渐渐的，查利发现了魔方的秘密。一种更高级的智慧生命在猎取人类的思维。他不知道这些生命为什么这么做，但他不愿意做这个试验品。
最终在拼完最后一块魔方之后，三个人周围的世界开始坍塌，很快，他们失去了知觉，然后在各自进入魔方的地方醒来。
查利看到了女儿，他站在病床边，而自己则是站在他的对面，卡格尔在他们的旁边，而WU，就躺在床上一动不动。查利去试探了一下他的呼吸。这时候，WU突然睁开眼睛。科林的构思是，WU睁开眼睛的这一瞬间，就是电影的结束点。但故事是不是真的结束了，那就要看电影最后的反响了。
秦艾的戏份说是重要，那的确很重要。他是魔方的载体，也是指引查利去调查真相的一条引线。但镜头其实就是一开始比较多。后面的其他“魔方”内容，他就是偶尔闪现几个镜头。本来科林是希望秦艾跟组，这样以后拍摄感觉会更好一些。但因为之前布诺的事，他觉得还是给秦艾集中拍摄一段后面需要用的镜头比较好。没必要拖着他那么长时间。
于是秦艾就在进组两个月之后顺利杀青了。他杀青这天，布诺大晚上捧着一大束鲜花敲开了秦艾的房门。这个架势差点儿把秦艾吓死。“你这是？”
布诺还有点儿不太好意思。“恭喜你杀青。”
恭喜就恭喜，何必送一束花，还是红玫瑰。你想吓谁？“谢谢。但是这束花……”
布诺挠了挠自己的头：“我在仔细思考之后，发现你说得对。是我自己觉得你太耀眼了，你吸引了我的全部目光。我应该是喜欢你的。希望你接受我的爱意！”