繼而，他又精簡朝廷辦事機構，將那些關係戶、尸位素餐的官員踢出隊伍，降低行政開支。又提拔有能力才學、心懷正氣的官員到關鍵崗位上，保證政令得到有效的執行。
然後，他又抓貪官典型，不僅抄沒家產，而且將犯案官員滿門抄斬，手段狠厲，頗有殺雞儆猴的架勢。
接著，他在各州府設立官學，主修奇淫技巧也就是後世的手工製造業，並減免學費，如有特長者，還可以發放獎學金。
其實這條是杏貞建議他這麼做的，社會的發展進步光靠杏貞一個人帶動是不可能的，必須將創造根植於整個民族的血液中，這個民族才有強大的那天。
最後，他又整頓軍務，將軍隊中高層流動起來，每兩年一換防，杜絕結黨營私以及吃空餉事情的發生，並對全軍進行思想改造，灌輸“家國天下”、“忠君愛國”、“保家衛國”思想，至於教材，則選用歷史傳統名篇《詩經.無衣》、《離騷》、《愛國詩詞摘要》等，重新從思想上塑造鋼鐵戰士。
為了追求士兵精神上的堅毅，他還敕令全國，全面禁止吸食鴉片，並不准許個人開設任何形式的煙館！而軍中已經成癮的士兵立馬發放撫恤金，剔除出隊伍。要知道《南京條約》的簽訂就是以林則徐虎門銷煙為導火索的，可見，奕謹整頓軍務的決心是多麼堅定。
這幾條一一實行下來，差不多用了大半年的時間。雖然中間也有一些波折，但最終結果是好的，整個大清從上到下，從官員到平民百姓，都如同那田裡的麥苗，煥發出了盎然生機。
不過，這一番整頓對大清來說是好的，對洋人來說可就不那麼美好了。
不說別的，就說一個軟弱可欺的政權對洋人有多麼大的好處。
首先，都說兵熊熊一個將熊熊一窩，整個政權若都是軟弱無能的，洋人大可以再發動幾次鴉片戰爭，逼迫大清簽訂幾個類似《南京條約》這樣的不平等條約。
其次，洋人可以在大清的地界上橫行霸道，將大清百姓看成是二等公民，而他們則可以作威作福。
再次，他們可以將鴉片這種精神成癮□□傾銷到大清，毫不費力的賺取大筆雪花銀，而且他們還可以通過鴉片來削弱大清的戰鬥力，穩固他們殖民侵略的地位。
所以對于洋人來說，一個懦弱無能的清政府無疑對他們是最有利的。可是這種有利形勢被皇位繼任者給打破了，新的皇位繼承人不僅快速的解決了內部隱患，而且對他們的鴉片傾銷策略迅速採取遏制政策，雖然沒有立馬撕毀《南京條約》，收回通商口岸，但其作為已經嚴重影響洋人撈金的速度了。
地位遭到挑釁，洋人自然不可能坐以待斃，而且他們自恃堅船利炮，絕對能再一次逼迫清政府簽訂不平等條約。
故而，由英國政府牽頭，英國國會通過對華戰爭的撥款案，決定再次派出遠征軍侵華。遠征軍由艦船和陸軍組成，艦船共70艘，陸軍士兵7000人，由鴉片戰爭中的功臣海軍中將懿律、駐華商務監督義律率領下，於黃海渤海灣處迫境。這次的英國遠征軍規模相較於鴉片戰爭，不僅艦船多了23艘，而且士兵也多了3000人，另其堅船利炮也有了一些改進，總而言之，相較於鴉片戰爭，此次英國遠征軍是抱著必勝的信念來掠奪大清資源的。