他在總結自己豐富臨床經驗的基礎上，創造性地提出了以氣、血、濕、熱、痰、食郁滯致病稱為“六郁”，成為中醫學辨證體系中的一個重要部分，對於後世內科學有非常重要的影響。
他不僅精通醫道，也愛好文學。劇作家湯顯祖與其交情甚篤。一日，湯顯祖登門造訪，恰逢朱午間小憩。他發現朱震亨書案上有篇文章：“牡丹亭邊，常山紅娘子，貌若天仙。巧遇推車郎，於芍藥亭畔，牡丹花下，一見鍾情。托金銀花牽線，白頭翁為媒，路路通順。擇八月蘭開成婚，設芙蓉帳結並蒂蓮，合歡久之，成大腹皮矣。生大力子，有遠志，操大戟平木賊，誅草寇，破劉寄奴，有十大功勞。當歸期，封大將軍之職。”
這是朱震亨巧集藥名成文的戲作。而湯顯祖讀後，大受啟發，回家巧妙構思，寫就了不朽之作《牡丹亭》，動人的情節，生動的人物形象，逼真的心理刻畫，優美的詞曲，不僅轟動當朝，還流傳後世，受到人們喜愛。
朱震亨晚年整理自己的行醫經驗與心得，寫成許多著作。臨終前沒有其他囑咐，只將隨他學醫的侄兒叫到面前誨之曰：“醫學亦難矣，汝謹識之。”說完便端坐而逝了。
第九章想像不到的帝國自然科學
說到元朝，我們會馬上意識到它軍力的強盛，地域的寬廣，這些方面在當時可以說都是處於世界超級地位的。但很少有人注意到當時元朝的科學技術的發展水平。從科技水平發達程度的角度說，中國歷史上沒有任何朝代達到像元朝那樣的居於世界領先集團之列的水平或程度，可是許多的歷史學教授們卻似乎沒有認真地加以講授，原因何在？
元朝的科學技術達到或取得很高的成就，其中天文學、數學等都居於當時世界先進地位。此時，領先於世界的阿拉伯與波斯科學技術傳入中國，原因恐怕在於元朝的帝國有實力徵調大批阿拉伯、波斯等地的科學、技術精英前來中國。這些精英掌握著當時世界上最先進的科學技術，他們大多是伊斯蘭教徒。
這些伊斯蘭教徒和其他先前來華穆斯林一道，與中國其他一些民族經過長時間的融合，遂形成一個新的民族——回回。回回把阿拉伯與波斯甚至希臘與羅馬的天文、數學、化學、地理、醫學、文學、哲學、歷史等各方面知識在中國加以傳播和介紹，其中尤以天文、數學等科技圖書最多。