由於家庭出身和社會影響所致，馮庸很早就從戎，歷升官階，但他志不在此。他與社會民眾頗多接觸，深感民眾生活艱苦。當直奉爆發第一次戰爭時，身在其中的馮庸對內戰殃民有深深的痛惜之心。馮庸曾這樣剖析自己的心態:「我個人19歲的時候就出去做事，在軍隊裡服務，彼時抱著一種直線的思想，打算做一個愛國的軍人，把從前軍閥官僚的惡習氣，統統打倒。不過到了民國十一年1922年戰爭的時候，我受了一個很大的打擊，就是有許多生死相依的青年同學，都因為戰爭而犧牲了，他們的壯志不但沒有做到半點，而且早早就把性性命喪掉，實在可惜之至。我因為受了這種重大的打擊，知道戰爭的確是殘酷的，也實在是以亂亡國家的，所以我就改了一種方針。「
在馮庸看來，偌大一個中國，內憂外患頻仍，國勢漸趨衰微，
主要原因是工業落後，要想改造這個混亂的社會，就得發展民族工業，培養大量的工業人才，走工業救國、教育救國的道路。
1926年，其父馮德麟病故後，馮庸退出軍界仍保留軍銜，準備興辦學校。馮德麟作為奉系軍閥早期將領，20多年間，累積了龐大的家產。馮庸召集欠債的人，當眾焚燒債券;又召集典押土地的人，當眾歸還地契，銷毀借據;再召集家人宣布，將馮家全部財產310萬銀元捐作馮庸大學的校產。當時人們對馮庸的義舉讚不絕口，有詩讚其「翩翩濁世佳公子「。
1927年春，馮庸大學破土動工，「晝夜加工，經之營之「，僅用四個多月的時間，即建成一座布局獨特，有教室、辦公室、宿舍達200餘間的大學校園。
一所新型的私立大學--馮庸大學在東北拔地而起，
在不到一個月的時間裡，「共招學生五班，預定數計180餘人，10月1日行校舍落成禮，10月10日正式開學，自此以後，黃底藍星，燦爛光輝的馮庸大學校旗，飄揚在中國的東北三省「。
馮庸大學校長馮庸在貫徹民國教育方針的同時，以強烈的愛國主義精神和獨特的視角，創立了「馮庸教育主義「，即「三綱「「八德「「八正「「教養「「始基「。「八德「則是馮庸教育主義的主要內容。「八德「為孝、悌、忠、信、禮、義、廉、恥八種道德觀念。「八正「是「八德「的補充，是實踐「八德「的方法。馮庸大學辦學方針是貫徹愛國主義的精神，以培養新人、改造社會為基本出發點，加強道德教育、實業教育、軍事教育和體育，並使它們結合起來。在進行這些教育的過程中，注重實用、實戰，著眼於培養道德純正、體魄健康、有武勇精神、懂軍事、會技術的新青年，從而達到愛國、救國的目的。在馮庸大學牆上寫上了辦學宗旨「造成新中華的青年「，極力主張把愛國主義、民族自立貫穿於教育實踐中。馮庸大學的精神核心，是以傳統的中國文化為根基，貫徹愛國主義精神，關心國家的前途，關心青年人的前途。
隨著馮庸大學名氣日盛，所遵循的馮庸教育主義鋒芒直指日本帝國主義，引起日軍強烈不滿，將之視為眼中釘、肉中刺。1931年19日清晨6點30分，瀋陽城淪陷，整個城市頓時陷入空前的劫難中。21日下午4點，馮庸大學和東北大學及東北大學工廠，均被日軍占領，日本兵在學校內進行全面搜查，搗毀了校舍、實習工廠、辦公設施等，將教室、宿舍的箱櫃洗劫一空。日本兵還蠻橫地強令學生們當天全部離校，不准再上課。
9月22日上午11時，日軍將馮庸大學校長馮庸逮捕監禁。關東軍司令本庄繁威迫被關押的馮庸出任東北領袖，組織滿洲獨立，並正式提出兩項條件:一是永遠脫離國民政府，宣布獨立國;二是承認日本在滿蒙一切已得權利。本庄繁還承諾，在軍力上由日方充分幫助，財政由滿鐵株式會社接濟，讓馮庸替代張學良主持東北政局。馮庸大義凜然，斷然拒絕:「因此若殺我，我亦死得光明磊落「，「死耳，誓不為賣國賊「。日本人認為馮庸還有利用價值，所以暫時未對馮庸下毒手。馮庸通過來探望他的老師給學校傳遞了一張紙條:「馮大師生速到北平。「學生們開始準備前往北平。