劉健排查軍屯到如今都沒緩過來，他瘦了一大圈，坐在圈椅上時，就像縮在水草邊的大蝦。他捧著一盅牛乳，正靜靜聽著，只有到不得不開口的時候，才用沙啞的聲音說話，再也不像以往中氣十足的大聲嚷嚷。他聞謝遷之言，幽幽道：「有理、有理。咱們薦一批，再命底下人薦幾個，恰如烏雲托月，將伯安顯出來。」
李東陽點頭稱是，三人就此定計。果不其然，朱厚照正是因算得太精、寸步不讓，反而落入圈套。王陽明初進東官廳時，所有人都覺他不會有什麼大作為，不過是一個吉祥物而已。誰知，還不到數月，他就讓所有人刮目相看。勛貴和宦官排擠他，不讓他掌握實權。他就索性撩開手，真箇就在底層軍士和軍屯中打轉。
勛貴子弟當面嘲諷他，他也不以為意。就這般轉了幾個月，他竟上奏直言軍屯的弊政。
王陽明在奏疏中指出，軍屯的管理太過粗放了，沒有計劃、沒有實地堪合，沒有確切分配，戶部和兵部也沒有專門的管理官員和直轄部門，就中央一道命令，軍隊就去屯田，根本沒有想過，軍官們憑什麼去管理自身，乃至與權貴抗衡？屯田又該如何分配調度才能保障將士們的權益？如今皇上重視軍務，所以會時時關注，一旦皇上有了更重要的要務，軍屯沒有制度保障，只怕不久後又會打回原形。
他對此還提出了應對之策，內閣次輔劉健既已對屯田的數目進行重新測量，那麼如今就應該趁熱打鐵，對屯田在豐年和災年的收成進行統計，估算一個區間，記錄於典冊之上。根據典冊，再依照將士的人數進行再分配。他建議以小旗為一耕種與訓練單位。
一小旗大概有十餘戶，小旗應對每一軍戶制定門面小牌，小牌之上對各家的丁口、籍貫都進行登記，編排既定，就造冊兩本，一本作為耕種和訓練的考勤記錄，一本則交由兵部作為核查的依據。
兵部也應設專門有司，專管軍隊後勤，並在衙門門口設銅匭和大鼓，軍士如有生活困難，大可來擊鼓鳴冤，或者往銅匭扔狀紙。此外，兵部該司每年年終還需上交報表，以備萬歲查閱。他還在奏疏末尾毛遂自薦，表示他王守仁願意擔任兵部軍屯部第一任長官。
如果說劉健是斷了豪強大族一時的財路，那王陽明這封奏疏就是力圖永遠絕掉這些人發財的路子。朱厚照雖然不願意過多地抬舉文臣，但是也不能把忠心耿耿且有才幹的官僚往地上踩。他只猶豫了兩天，就下定決心，在例朝上對王陽明大加讚賞，並且安排吏部、戶部與兵部協作，再出一個具體條陳，交由廷議。事後，他還賜了王陽明五十兩黃金。
王先生果斷收下賞賜，一回去就請了十來個武林高手做護衛，在東官廳設下小廚房，從家裡挑了兩個忠心老僕專門為他做飯，兩個機靈的僕人為他看顧住所，還找了一個大夫隨時候著。他依靠這一番布置，躲過了數次暗殺、下毒，牢牢坐穩了東官廳二把手的交椅。此後，鎮遠侯掌練兵，王侍郎掌後勤，谷太監監督上下的格局正式確立。京軍一改往日的窮困無能，終於漸漸有了正規軍的樣子。