山根博士专精的古生物学，是专门研究已死生物的科学，虽然看起来是一门人畜无害的学问，但如果是种消灭生物的化学武器，就不可能免于俗世的索求。一九四八年发生了使用氰化物杀人夺财的「帝银事件」，精湛的手法令许多人议论是否为七三一部队的前队员，但此方面的调查却因为GHQ的指示而中止，最后嫌犯身分便锁定在画家平泽贞通身上(注45)。荻原记者采访芹泽博士时，芹泽立刻否定自己认识萩原口中的德国人，当萩原继续发问：「那么您现在又是做什么研究呢?」，芹泽博士继续顾左右而言他，回道：「不是什么值得一提的事情」。芹泽博士的这种态度反而更加引起观众的好奇，让人不禁怀疑起玄关上的「芹泽科学研究所」是个幌子，其实只是用来隐藏芹泽是专精「化学」的博士。
有很多点可以说明氧气破坏剂中的药剂是一种水溶性的毒气。电影里能看到芹泽博士不用助手也能在地下研究室制造，而且要戴上黑色手套放进鱼缸内才能设置完成，还有为了避免鱼缸内的反应会伤害到惠美子，芹泽一边抱住惠美子，一边警戒鱼缸冒出的有毒气泡。再说，既然他说氧气破坏剂是恶魔的发明物，那么在制造的难度上，也许是简单到随便一个生手都能制造出来。化学武器素来有「穷人的核武」之称，和原子弹的制造过程相比，通常只需要较小的设施就能大量制造，光从东京地铁的沙林毒气事件就能证明这个论点。比起需要出动国家级的研发计划才能制成的原子弹、氢弹，一九五四年的日本绝对有能力大量制造化学武器。
氧气破坏剂这种化学武器除了合乎原子弹所拥有的一发逆转战局能力，此外能透过一人之手来大量生产，也足以向化学武器一样至少报对手一箭之仇。而且，因为毒气这类化学兵器早在第一次世界大战就以德国为中心实战化，一方面其形象远比原子弹清晰，而且对于不得开发、实验、拥有核武的日本来说，更是比较适合的武器类别。
当然，芹泽博士就和(某种意义上)在乎求知胜过防灾的山根博士一样，也属于「疯狂科学家」的这个系谱。系谱起于制作出科学怪人的弗兰肯斯坦博士，他平时住在阴暗的房子里与研究为伴，养育着孤独。特别是芹泽博士的内心，还同时交杂着想在现世中有所贡献的奉献精神、想被社会广泛认可的认同期待，以及对自己创造物的罪恶感。然而想要斩断这些苦恼就只有一个办法，那就是为了世人公开自己不可告人的秘密并且打倒哥吉拉，最后再以自行了断的方式将秘密永远尘封在海底。芹泽博士和哥吉拉两者都有各自的主体性，但却也因此而有着深刻的连结，而变得像是弗兰肯斯坦博士和科学怪人之间的关系。而且在死亡后，两者都会因此永垂不朽。
不过，《哥吉拉》电影中所表达的涵义下不只是如此。其中所要陈述的问题是，本该是武器的模拟「实验」结果反而演变成「正式」的灾难。尤其唤醒哥吉拉的氢弹试爆，原本就是以预测未来的第三次世界大战为氢弹战争作前提，才因应而生的实验。惠美子在芹泽博士的实验室水缸所看到的鱼类死绝惨况，不过只是实验而已，要是累积实验所完成的「实作」，会带来什么后果?因此，最后哥吉拉和芹泽博士同归于尽的场面，和科学怪人杀死弗兰肯斯坦博士的结尾(注46)有着相似的氛围。此时要呈现给观众的，不只是为群体带来和平所要付出的代价，也同时呈现了作为实验结果的「实作」有多么残酷。
第四章 原始怪兽乎?原子怪兽乎?