看到隆美爾的部隊已經狼狽不堪，蒙哥馬利命令紐西蘭師由防區向南打進去，從而封閉德軍早先進入的缺口。隆美爾這時看到了危險，而且發現他的油料實際上只夠用一天了，於是下令撤退，並迅速撤至了他們早先已通過的布雷區，準備據守這一地區。
9月3日，英軍在蒙哥馬利指揮下，開始發動反擊。蒙哥馬利拒絕了一切“要求坦克發起攻擊”的請求，並在實際上禁止霍羅克斯繼續追擊敵人和占領希邁馬特高地。他說，要讓隆美爾在那裡保留一個觀察哨，以便德軍能夠看到他為準備下一次戰役所採取的種種欺騙措施。這使得隆美爾很快獲得了安定。到9月7日，非洲軍團已在英軍原來的地雷場及其後方站穩了腳跟。於是，蒙哥馬利下令停止這次作戰。
在阿拉姆哈勒法之戰中，德軍損失了約2900人和49輛坦克及裝甲車輛；英軍損失了1700人和67輛坦克，其中13輛“格蘭特”式坦克尚可修復。英軍在戰場上開始掌握了主動。
蒙哥馬利對戰果表示滿意。他認為，第8集團軍在這次戰役中的表現，證明他們是當之無愧的精銳之師。更重要的是，第8集團軍又是一支士氣高昂的部隊了。
有一種批評意見，認為在這次戰役後期，蒙哥馬利失去了一個消滅非洲軍團的機會。這當然是針對蒙哥馬利在9月3日以後的反擊中禁止使用坦克部隊而言的。他們這樣說：“蒙哥馬利也許會辯解，他禁止在阿拉姆哈勒法戰役後期使用裝甲部隊，是為了阿拉曼戰役。而實際情況是，他本來可以不需要阿拉曼就可取得決定性勝利的。”這一批評是偏頗的。在這次戰役後期，蒙哥馬利確實是有些過于謹慎，以至於沒能擴大戰果，這是他的弱點。但消滅非洲軍團的機會其實並未出現。對隆美爾來說，他更歡迎英軍對他進行繼續追擊。因為他既缺乏汽油，又無制空權，只有讓英軍遠離陣地，他才有機會和英軍放手一搏。而英軍這邊，第8集團軍的訓練狀況並不讓蒙哥馬利放心，他們在此前並未受過充分的作戰訓練，貿然進攻，很有可能會反勝為敗。這種可能性是存在的，決不是危言聳聽。
阿拉姆哈勒法戰役就這樣按蒙哥馬利的設想打贏了。而蒙哥馬利的頭上也多了一頂奇怪的帽子——一頂澳大利亞軍帽。因為在澳大利亞陣地外，只有他戴這種帽子，很快他就因帽子而被人熟識。大家見他對帽子的標新立異，於是開了一個玩笑，送了他一頂黑色貝雷帽，上面別了一對帽徽。蒙哥馬利欣然接受了。整個戰爭期間，這頂帽子再也沒有離開過蒙哥馬利。蒙哥馬利常常不無得意地對人說：“如果你高興的話，可認為貝雷帽已成為我的標記。此外，戴著它也是很舒服的。”
阿拉姆哈勒法戰役儘管只是一次防禦作戰，但其意義卻不可低估，它對隆美爾的打擊，不僅是物資人員上的，更是心理上的。對這次失敗的教訓，隆美爾一直銘記到死，並且對他在1944年對諾曼第防禦的看法產生了重要影響。他說：“誰要是被迫同完全掌握了制空權的敵人作戰，即使他擁有最新式武器，也將像原始人同現代歐洲軍隊對陣一樣，處境十分艱難而絕無勝利的可能。”隆美爾的作戰參謀馮·梅林津後來在《坦克戰》一節中，也把阿拉姆哈勒法之戰描述為“沙漠戰爭的轉折點，是各個前線一系列敗仗中的第一個敗仗，預示了德國的戰敗”。