同樣的道理，一些遺址中利用廢棄坑和窖穴無規則的埋葬死者，也是一種人祭的表現。仰韶文化以後，利用廢棄坑葬人的現象比較普遍，這些坑中的人骨，一般都不規整，有的側身屈肢，有的為俯爬式，有的作掙扎狀，均屬非正常死亡，應與人祭有著內在的聯繫。
仰韶文化時期，利用灰坑埋葬死者的現象就已經出現。半坡遺址曾發現兩個利用廢棄的灰坑埋葬死者，這兩個灰坑中的死者，緊靠灰坑邊緣，一個側身屈肢，上肢曲合於面前，呈一種自然的睡眠狀；另一個左腿下屈而後折，其形狀像是掙扎後死去的；兩座墓均無隨葬品，為半坡遺址中一種特殊的例證。
在陝西華陰橫陣仰韶文化遺存中，一個深2.15米的圓形袋狀灰坑（H103）共埋有16具人骨架，分3層埋放。第一層埋8具，第二層埋6具，第三層埋2具，呈屈肢狀。有的在人骨架的腹部壓著巨大的石頭，像是有意砸下去的，又像是被活埋的，或是被打死後胡亂埋葬的。他們像是戰爭中敵對部族的犧牲者和被處死的戰爭俘虜，他們被扔棄在廢坑中或採用屈肢葬法，都是為了同本氏族和本部落的人們區分開來①。
在客省莊二期遺存中，發現有6個灰坑同時埋有人骨架和獸骨架，人的骨架有散亂的，有殘缺頭骨、肢骨的，有的人骨和獸骨疊壓在一起。
在西水坡仰韶文化遺址，曾發現兩座灰坑葬，每個灰坑各埋一人，兩具骨架都保存較好，但均無頭骨。另外還有一座土坑葬，墓邊清楚，骨架保存較好，但缺少左上肢和兩腿的膝部以下。上述兩種情況，可能是被獵首和斷肢後埋入的。
到龍山文化時期，利用灰坑埋葬或斷肢葬俗的現象更為普遍。在黃河中游的新石器時代文化中，考古學上的廟底溝二期文化，大致屬於中原地區早期階段的龍山文化時期，也是由仰韶文化向龍山文化的過渡期，碳十四測定的年代為公元前2900-2300年間。在陝西武功縣發掘的廟底溝二期文化的墓葬中，幾乎所有的骨架都不齊全，有的骨架缺頭，有的缺腿，有的四肢不全，有的缺少肋骨和盆骨，有的缺少右臂和左腿，有的缺少下顎骨，有的缺腳趾骨，有的僅埋葬一個頭骨。這些墓葬多數沒有隨葬品。
在邯鄲龍山文化遺址中，發現兩種埋葬死者的異常現象，一種是在一個